매년 5월, 종합소득세 신고가 시작되면 ‘종합소득세 환급금 조회’에 대한 관심도 함께 높아집니다.
이미 납부한 세금이 실제로 내야 할 세금보다 많다면 환급을 받을 수 있으며, 홈택스나 손택스를 통해 간편하게 확인할 수 있습니다.
이 글에서는 종합소득세 환급금이 발생하는 이유부터 환급금 조회 및 신청 방법까지 2025년 기준으로 정리해드립니다.
종합소득세 환급금이 발생하는 이유
5월에 하는 종합소득세 신고는 지난해 소득에 대한 것입니다.
예를 들어, 2025년 5월에 신고하는 것은 2024년 1월 1일부터 12월 31일까지의 소득입니다.
소득신고를 하면 세금만 내는 줄 아는 경우도 있지만, 환급이 발생할 수도 있습니다.
종합소득세 계산 시 공제·감면 항목이 적용되며, 이미 납부한 세금이 있으면 이를 차감합니다.
프리랜서라면 급여에서 3.3% 원천징수가 되었을 수 있고, 개인사업자는 중간에 일부 세금을 냈을 수 있습니다.
금융소득 역시 세금이 원천징수되죠.
이렇게 미리 납부한 세금이 실제 납부해야 할 세금보다 많으면 환급이 발생합니다.
종합소득세 환급금 계산 기준 및 조건
환급을 받으려면 반드시 종합소득세 신고기간(매년 5월 1일~31일) 내에 신고를 완료해야 합니다.
신고 대상임에도 신고하지 않으면 미신고 가산세가 부과됩니다.
종합소득세는 다음 공식으로 계산됩니다:
납부(환급)세액 = ((종합소득금액 – 종합소득공제) × 세율) – 세액공제/감면 – 기납부세액
- 종합소득공제 : 인적공제, 국민연금 납부액, 노란우산공제 등
- 세액공제/감면 : 창업중소기업 세액감면, 고용증대세액공제 등
- 기납부세액 : 중간예납세액, 원천징수세액 등
공제·감면·기납부세액이 실제 세액보다 크면 환급 대상이 됩니다.
신고서 마지막 ‘납부(환급)할 세액’ 항목에서 금액이 마이너스(-)면 환급, 플러스(+)면 납부입니다.
찾아가지 않은 환급금은 최초 지급요구일부터 5년이 지나면 국고로 귀속됩니다.
종합소득세 환급금 조회 방법 2가지
종합소득세 환급금이 발생했다면, 가장 먼저 해야 할 일은 정확한 환급금 조회입니다.
홈택스와 손택스 모두에서 종합소득세 환급금 조회가 가능합니다.
1. 홈택스
홈택스에서 조회하는 방법은 다음과 같습니다.
- 홈택스 접속
- 납부/고지/환급 > 환급금 상세조회

- 로그인 (본인인증)
- 조회기간 설정 및 환급금 조회

조회 시 기간은 넉넉히 설정하고, ‘전체’ 구분을 선택하면 편리합니다.
최대 5년까지 조회가 가능합니다.
2. 손택스 (모바일 앱)
모바일에서 확인하려면 손택스 앱을 설치하세요:
- 손택스 실행
- 전체메뉴 > 납부/고지/환급 > 국세납부 > 환급금 상세조회
- 로그인 (본인인증)
- 조회기간 설정 및 조회

홈택스와 절차는 거의 같으며, 모바일이 편하다면 손택스를 추천합니다.
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📌 손택스 앱 설치
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종합소득세 환급금 신청 방법
2024년부터 홈택스에서는 ‘원클릭 환급 신청’ 기능이 도입되었습니다.
종합소득세 신고서를 제출한 후, 별도 메뉴 이동 없이 간단히 환급 신청까지 한 번에 완료할 수 있습니다.
환급금은 아래 순서대로 지급됩니다.
- 신고서에 지정한 계좌
- 환급계좌개설 신고 계좌
- 현금 지급 (우체국 방문)
신고서에 환급계좌를 기재하지 않았다면 홈택스에서 환급계좌개설 신고를 하거나 우체국에서 환급통지서를 지참해 수령할 수 있습니다.
- 홈택스 메뉴 : 납부고지/확인 > 환급계좌개설 신고/변경 신고


- 환급금은 신고 후 보통 3일 이후부터 입금 시작
✅ 홈택스 ‘원클릭 환급 신청’을 이용하면 별도 절차 없이 더욱 간편하게 환급 절차를 마칠 수 있습니다.
📌 홈택스 원클릭 환급 신청 방법 자세히 보기
종합소득세 환급금 입금 시기 알아보기
환급일은 고정되어 있지 않으며, 신고 후 보통 30일 이내에 입금됩니다.
일반적으로 6~7월 사이 수령하게 됩니다.
빨리 신고한다고 환급이 빨리 되는 것은 아니며, 환급 시기는 지역 세무서 및 담당자에 따라 다를 수 있습니다.